这时的清军的船队根本就没有抵挡之力了，虽然有几艘和商家军的战船靠帮，但清军的船小，士兵们难以爬上商家军的战船去，何况在每一艘商家军的战船上至少都有几十支步枪守卫着，也跟本不给清军登船的机会。而且过不了一会儿，商家军战船的侧舷火炮就会在最近距离内开火轰击，只用一轮火炮齐射，就足以将清军的战船打散了架。因此蹬船作战根本就没可能施行。
而就算是有一些火箭落到甲板上，也不要紧，因为清军火箭的数量不多，燃烧力有限，而且在每艘船上都有专门付责灭火的水手，而且使用的灭火工具并不仅是水，还有糊状的泥砂浆，只要是有火箭落下，一勺泥砂浆倒上去，就是火油点着，也可以马上就盖灭了。
因此清军对商家军几乎造不成任何的危胁，只能任由商家军的战船在自己阵中直线突进，然后任意开炮轰击。
清军的水军大部份本来就是由降军组成，一开始还能仗着自己船多，可以顶一阵子，但随着商家军的战船在清军阵中突进深入，双方近距离接战，发现商家军的海军不是靠船多就能够战胜的，清兵们顿时都泄了气，何况商家军的火力还如此猛烈，因此谁也没有心情再打下去了，纷纷都只想着撤退。
但这时清军的战船还有一百五六十条，而且己经阵形大乱，谁都想早一点逃跑，但船在水里的运动可不像人在岸那么灵活，再加上互相都争先恐后，你抢我夺，江面也只有这么多的地方，结果有不少战船都互相拥挤、碰蹱，反到是挤在一起，谁也动弹不了。还有几艘船因为碰蹱，进水下沉。
在这种情况下，商家军的战船只用对准一个大概的方向开火，几乎就能够百发百中。因此整个战场也都成为商家军的打靶练习。
不过清军的战船数量实在是太多了，在外围的战船先撤离了战场之后，江面上的空间也渐渐开阔了起来，因此也有越来越多的战船都有足够的活动空间。而先调头撤离战场的战船，侧纷纷拼命的摇桨荡橹，向龙山船厂里逃跑，而还有三十多条实在逃不了战船，只好选择向商家军投降。
这一战的目地可不仅仅只是打败清军的水军，而是要连整个龙山船厂全都催毁，彻底消除清军的海上力量。因此黄震也立刻下令，只留下十艘船来处理接受清军的投降事务，其余的战船分为三路纵队，追求清军的逃跑船只，向龙山船厂发动进攻。
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就在商家军的海军向龙山船厂进攻的时候，在南京的外线，成进也率领着自己的人马，向高淳县发动进攻。
这一次进攻高淳县的是第一军的第一、五师，第一、五旅。另外还有一个骑兵团。剩下的第九师由副军长赵英杰带领，留守建平县。
高淳离建平大约有五十里的路程，因此虽然这一战也是在十二月三十日这一天开始，但在二十九日中午，成进就带着第一、五师先行动身出发。在当天的黄昏时分，人马到达离高淳只有十里距离的广通镇驻扎，由于到达广通镇的时间，天色己晚，因此虽然是近在咫尺，但高淳县的清军对此并没有一点查觉。
休息了一夜之后，第二天一早，成进立刻带领着两个师，直扑高淳县而去。