刘进忠投降，也将大西军在凤凰山一带的驻军分布、虚实全部都告诉给吴三桂和尼堪。
得知这时大西军人马虽多，但的几员主将孙可望、刘文秀、艾能奇、冯双礼等人这时都不在张献忠的身边，吴三桂认为应该抓住战机，立刻出击，但尼甚对此却半信疑，又担心大西军人马众多，因此也举棋不定。
吴三桂见状，决定独自出击，在顺治三年（1646年）十一月二十六日，下令以刘进忠为向导，部将高大节率领精锐骑军，轻装疾进，出其不意，对大西军发起突然袭击。
二十七日清晨，清军隔太阳溪与张献忠的大西军相遇。面对这意外的突然来袭，张献忠率军创促应战，指挥大西军马步兵迎战清军。
中午十二时左右，吴三桂率大军赶到战场，遣部将胡国柱向大西军右翼进攻，郭壮图攻击大西军左翼。自己亲率人马，中路进攻，战斗打得非常激烈，一直打到黄昏时分，大西军终于抵挡不住，全线溃败。
就在这时，张献忠带着十几名卫士在太阳溪边督战，刘进忠为吴三桂指点道：“这就是八大王。”吴三桂立刻下令，向张献忠齐发乱箭，在混乱之中，张献忠中箭身亡，清军大获全胜。而这时马宝、夏国相也攻克了成都。
在张献忠死后，部将孙可望、刘文秀、艾能奇、冯双礼等不敢再向陕西进军，众人合兵之后，决定以孙可望为首，率军向南，在重庆府境内，受到明降将曾英部的阻击，经过了一番激战，孙可望等人军击败了清军，并临阵斩杀了曾英。这时孙可望本打算继续率军进攻，夺取重庆做为川中的立足之地，但这时吴三桂己命大将高大节、王屏藩率军来增援重庆，因此孙可望等人也不敢在重庆停留，率军南下，向贵州方向转移，后来退进了云南。
而吴三桂本来就打算在四川占地割据，在占领了成都和重庆这两个四川最重要的城市之后，也忙于稳固占领地区，设将守卫，招降大西军的余部，因此也没有去追赶孙可望等人。
这时张献忠的势力基本全部都退出了四川省，而吴三桂抢占了成都、重庆、潼川、夔州等川中地区，而尼堪率领的清军占领了川北地区，而在川南地区，还有不少明朝的残余势力。而四川的战事也暂时告一段落。吴三桂和尼堪各守各自的占领区，暂时也都相安无事，并向北京的清廷报告了四川的战事经过。
玄皇教过去在四川也进行过布置，虽然没有南方这么深厚，但也有一定的基础，打听一些基本的消息和动向，还是做得到的，现在经过了明石姬的改造之后，也都成为商毅现在的情报网络，不也四川和浙江两地，一个长江头，一个长江尾，相隔万里，其间又有千山万水，因此从四川把消息传回来，至少也要一个月以上的时间。去年十一月就发生的事情，一直到今年开年之后，商毅才收到。不过这也是没有办法的事情，离着这么远，就是用信鸽也不好使。
从时间上看，大西军在四川败亡的时间和另一时空差不多，不过清军占领四川的时间提前了，而且吴三桂居然真的挪到四川去了。可以说现在的局势也变得越来越复杂，当然也越有趣了。
不过四川土地肥沃、资源丰富，素有“天府之国”之称，在中国版图中的地位虽然十分重要，但由于地理位置过于偏避，交通也不便利，始终起不到决定性的作用，也有“天下未乱而川先乱，天下未定而川先定”之话。因此吴三桂虽然占领了四川，但恐怕也难成大器。当然也不能对他掉以轻心，因为如果四川和清廷携起手来，对自己来说还是相当不利的。
商毅想了一想，对明石姬道：“我们在四川的情报人员有多少？都是以什么身份隐藏？”