等罗远斌发出的消息传到南京的时候，南京政府刚刚正式宣布了商毅将要称帝的消息，举行大典的时间就定在十月十八日，离现在大约还有两个多月。因此大西军向中华军投降、将云南全境都移交给中华军的消息，也正好为宣布商毅称帝的消息送上了一份贺礼。
不过大西军的归降，和云南的和平收复，也确时居有很重大的意义，这就意味着中国西南二省贵州、云南都己经正式纳入了南京政府的版图内。
这个时代的贵州、云南二省的地域和后世相比，在大体上差不多，只是一些细节地方略有一些不同，总面积大约有六十万平方公里左右。在万历年间，统计户籍人口是：贵州省四万三千四百五十户，二十九万九百七十二口，云南省一十三万五千五百六十户，一百四十七万六千六百九十二口。
不过这些数字的准确性并不高，因为这时云贵二省两省都是少数民族比较集中的地区，明朝在这两个省设立了相当多的宣慰司、宣抚司、安抚司、长官司等地方行政机构，相当于少数民族自治区一样，因此人口户籍的统计，有相当大的漏洞，否则以云南者一百四十多万的人口基数，根本供应不起十万以上的军队。
但不管怎么说，收复了云贵两省，也使南京政府的版图再度扩大，整个西南地区，也是整个南方地区，只剩下一个四川了。
商毅首先下令内阁，立刻着手向云贵两省派遣官员，建立地方行政机构，并且着重强调，云贵两省的少数民族众多，因此派出二省的地方官员们一定要注意处理好与民族关系，尊重各少数民族的风俗传统，不得歧视，更不许侍强凌弱。
其实汉族总体来说，是一个包容很强的民族，对于大部份的少数民族，都能够接纳并且与之很好的相处，许多少数民族己经完全和汉族溶合了。
而且中国的各朝各代也都比较重视处理和少数民族之间的关系，因此到于这个时候，绝大部份的少数民族和汉族总体来说还是十分友好，和平相处，当然也会出现明朝的地方官员和少数民族中的头人、酋长相互勾接，欺圧少数民族平民的事情，另外也有一少部份少数民族的野心者、顽固份子或极端民族主义者借这些事情搬弄事非，挑拔少数民族与汉族不和，甚致聚众反叛，自立为王等等。
因此商毅也制定了三条处理民族关条的原则：努力的团结少数民族中的亲汉份子，尽可能的争取少数民族中的中间派；但对少数顽固份子，决不能手软，坚决消灭，以儆效尤。同时江西军区暂时也就驻扎在云贵两省，帮助地方官员尽快稳定两省的局面，恢复社会秩序和农业生产。
而这时在四川地区，前线的指挥官段鹏和李牟联名将南京政府的决议，派人转交给了吴三桂。对于吴三桂提出投降的条件，南京政府的答复是：吴三桂必须接受无条件投降，南京政府除了可以保证吴三桂的生命安全之外，其他一切的条件都不能答应，只能等吴三桂投降之后，听候南京政府的处理，并令吴三桂限期答复。
接到了这一份决议，吴三桂又悔又恨，后悔自己当初怎么就利令智昏，拒绝了南京政府提出的优厚条件，弄得现在走投无路，只能坐以待毙；而又恨商毅太不讲道理了，完全是逞强压弱，仗着中华军的兵势强大，连一条退路都不给自已留，硬是逼自已无条件投降，将生死全部都拱手交给他人，这也太欺负人了吧。